面积为１９．８５万平方公里，是位于中亚东北部的内陆国，北、西、南面分别同哈萨克斯坦、乌兹别克斯坦及塔吉克斯坦接壤，东南部与中国新疆为邻。境内多山，全境海拔在５００米以上，其中百分之九十的领土在海拔１５００米以上，１／３的地区在海拔３０００～４０００米之间。天山山脉和帕米尔－阿赖山脉绵亘于中吉边境。胜利峰为最高点，高达７４３９米。低地仅占土地面积的１５％，主要分布在西南部的费尔干纳盆地和北部塔拉斯河谷地一带。这种高山地形使该国拥有丰富的水力资源：在它境内有６个水力发电站，向邻近的几个原苏联共和国提供电力。高山地形也为多种动植物的生长提供了良好的条件。吉尔吉斯斯坦动植物品种繁多，植物达４０００种左右，有“山地绿洲”的美称。南部有上千年的桃木林，山中有珍奇动物马鹿、马熊、猞猁、雪豹等。主要河流有纳伦河和楚河。属大陆性气候。大部分谷地的平均气温１月份为－６℃，７月份为１５～２５℃。年降水量中部为２００毫米，北部和西部山坡为８００毫米。地处东部崇山峻岭中的伊塞克湖水面海拔高度１６００余米，面积６３２０多平方公里，在世界高山湖泊中水深数第一、集水量第二。湖水清澈澄碧，终年不冻，是有名的“热湖”，有“中亚明珠”的美誉，是中亚地区旅游疗养的胜地。湖区气候宜人，风景美丽，湖泥中含有多种微量元素，可治疗多种疾病。